Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC9A8Q9Y2E8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A8Q9Y2E8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms