Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms