Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAVIN3Q969G5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms