Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX3Q8N9I9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms