Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYB8

SUPV3L1, ATP-dependent RNA helicase SUPV3L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPV3L1Q8IYB8 ARID1B-231ENST00000637887 1468 ntTSL 55.4□□□□□ -1.545e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.4□□□□□ -1.555e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 TP53BP1-214ENST00000480860 586 ntTSL 35.34□□□□□ -1.555e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PPP2R2A-215ENST00000521557 601 ntTSL 45.01□□□□□ -1.615e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.615e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PTBP2-208ENST00000476783 779 ntTSL 1 (best)4.98□□□□□ -1.615e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PTBP2-210ENST00000492905 776 ntTSL 1 (best)4.98□□□□□ -1.615e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PPP2R2A-219ENST00000523473 654 ntTSL 44.92□□□□□ -1.625e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.625e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 STX3-202ENST00000528805 615 ntTSL 1 (best)4.9□□□□□ -1.635e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 THOC1-207ENST00000579891 815 ntTSL 54.88□□□□□ -1.635e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PPP2R2A-213ENST00000521095 579 ntTSL 34.81□□□□□ -1.645e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.645e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LEPROT-203ENST00000484243 549 ntTSL 34.77□□□□□ -1.655e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 GPCPD1-205ENST00000481038 6649 ntTSL 24.69□□□□□ -1.665e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 MAP2K5-207ENST00000558021 538 ntTSL 34.63□□□□□ -1.675e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.685e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.695e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ADNP2-203ENST00000560561 647 ntTSL 34.48□□□□□ -1.691e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PPP2R2A-220ENST00000523925 529 ntTSL 34.47□□□□□ -1.695e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.75e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.75e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 BRD8-206ENST00000425764 546 ntTSL 44.34□□□□□ -1.715e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 BRD8-226ENST00000515254 557 ntTSL 24.34□□□□□ -1.715e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LIG3-211ENST00000588713 467 ntTSL 24.34□□□□□ -1.715e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PPP2R2A-216ENST00000522150 573 ntTSL 54.32□□□□□ -1.725e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 MAP2K5-206ENST00000557869 412 ntTSL 34.26□□□□□ -1.735e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ANK3-228ENST00000616444 2939 ntTSL 54.16□□□□□ -1.745e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.755e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CCNY-206ENST00000470025 346 ntTSL 53.99□□□□□ -1.775e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.785e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 FAM133B-206ENST00000468931 189 ntTSL 53.88□□□□□ -1.795e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 THOC1-206ENST00000579232 2277 ntTSL 53.83□□□□□ -1.85e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 HDAC2-216ENST00000523628 549 ntTSL 43.81□□□□□ -1.85e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SMYD3-205ENST00000453676 562 ntTSL 43.81□□□□□ -1.85e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.85e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.85e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 FAM133B-209ENST00000490747 717 ntTSL 33.65□□□□□ -1.835e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PPP2R2A-221ENST00000523964 567 ntTSL 43.58□□□□□ -1.845e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.855e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ANK3-221ENST00000511043 562 ntTSL 33.5□□□□□ -1.855e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.875e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 MRPL3-204ENST00000506946 384 ntTSL 33.29□□□□□ -1.885e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.881e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 API5-209ENST00000532267 337 ntTSL 33.17□□□□□ -1.95e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 HDAC2-202ENST00000425835 553 ntTSL 23.11□□□□□ -1.915e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 HDAC2-213ENST00000522371 502 ntTSL 43.11□□□□□ -1.915e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PPP2R2A-214ENST00000521484 556 ntTSL 43.09□□□□□ -1.915e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 THOC1-215ENST00000583228 2791 ntTSL 23.06□□□□□ -1.925e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 KIF13A-209ENST00000505588 212 ntTSL 52.91□□□□□ -1.945e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.975e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 OSBPL8-207ENST00000548341 542 ntTSL 42.54□□□□□ -25e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -25e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PPP2R2A-210ENST00000519636 575 ntTSL 52.53□□□□□ -25e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PPP2R2A-217ENST00000522482 576 ntTSL 42.53□□□□□ -25e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RERE-218ENST00000514428 273 ntTSL 32.01□□□□□ -2.095e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 THOC1-205ENST00000578529 2681 ntTSL 51.97□□□□□ -2.095e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SPAG9-220ENST00000515685 292 ntTSL 21.52□□□□□ -2.175e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.255e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 NIPSNAP2-209ENST00000472404 250 ntTSL 50.6□□□□□ -2.315e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CROCCP2-201ENST00000362058 2029 ntTSL 224.88■■□□□ 1.572e-10■■■■■ 81.2
SUPV3L1Q8IYB8 CROCCP2-203ENST00000635081 1904 ntTSL 520.42■□□□□ 0.862e-10■■■■■ 81.2
SUPV3L1Q8IYB8 ATP6V1B2-202ENST00000519667 670 ntTSL 1 (best)20.05■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 81.2
SUPV3L1Q8IYB8 CROCCP2-206ENST00000639594 2175 ntTSL 1 (best)19.3■□□□□ 0.682e-10■■■■■ 81.2
SUPV3L1Q8IYB8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 81.2
SUPV3L1Q8IYB8 CROCCP2-204ENST00000639456 2575 ntTSL 518.55■□□□□ 0.562e-10■■■■■ 81.2
SUPV3L1Q8IYB8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.47■□□□□ 0.392e-10■■■■■ 81.2
SUPV3L1Q8IYB8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 81.2
SUPV3L1Q8IYB8 ATP6V1B2-203ENST00000520830 649 ntTSL 316.49■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 81.2
SUPV3L1Q8IYB8 BSG-205ENST00000571735 2155 ntTSL 216.48■□□□□ 0.233e-8■■■■■ 81.2
SUPV3L1Q8IYB8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 81.2
SUPV3L1Q8IYB8 ATP6V1B2-205ENST00000523478 572 ntTSL 413.6□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 81.2
SUPV3L1Q8IYB8 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 81.2
SUPV3L1Q8IYB8 AC019080.1-207ENST00000447413 1182 ntTSL 1 (best)11.76□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 81.2
SUPV3L1Q8IYB8 TRAF3-201ENST00000347662 7700 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 81.2
SUPV3L1Q8IYB8 NFE2L2-211ENST00000464747 2749 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 81.2
SUPV3L1Q8IYB8 TRAF3-209ENST00000560463 701 ntTSL 38.25□□□□□ -1.092e-6■■■■■ 81.2
SUPV3L1Q8IYB8 ATP6V1B2-206ENST00000523482 6907 ntTSL 26.37□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 81.2
SUPV3L1Q8IYB8 AC019080.1-202ENST00000456746 5147 ntTSL 26.19□□□□□ -1.422e-6■■■■■ 81.2
SUPV3L1Q8IYB8 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.452e-6■■■■■ 81.2
SUPV3L1Q8IYB8 MICALL2-208ENST00000472100 5248 ntTSL 217.94■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 81.1
SUPV3L1Q8IYB8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 81.1
SUPV3L1Q8IYB8 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 80
SUPV3L1Q8IYB8 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 80
SUPV3L1Q8IYB8 CHD2-201ENST00000394196 9363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.928e-7■■■■■ 79.8
SUPV3L1Q8IYB8 CHD2-226ENST00000636881 3545 ntTSL 59.13□□□□□ -0.958e-7■■■■■ 79.8
SUPV3L1Q8IYB8 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.348e-7■■■■■ 79.8
SUPV3L1Q8IYB8 CHD2-221ENST00000635856 4236 ntTSL 56.62□□□□□ -1.358e-7■■■■■ 79.8
SUPV3L1Q8IYB8 CHD2-227ENST00000637572 4452 ntTSL 55.3□□□□□ -1.568e-7■■■■■ 79.8
SUPV3L1Q8IYB8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.538e-7■■■■■ 79.6
SUPV3L1Q8IYB8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.138e-7■■■■■ 79.6
SUPV3L1Q8IYB8 USP6NL-204ENST00000606752 1823 ntTSL 1 (best)20.72■□□□□ 0.911e-11■■■■■ 79.6
SUPV3L1Q8IYB8 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.321e-11■■■■■ 79.6
SUPV3L1Q8IYB8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 78.5
SUPV3L1Q8IYB8 PTBP2-209ENST00000482253 2029 ntTSL 218.79■□□□□ 0.64e-6■■■■■ 77.8
SUPV3L1Q8IYB8 PTBP2-201ENST00000370197 3057 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.924e-6■■■■■ 77.8
SUPV3L1Q8IYB8 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.044e-6■■■■■ 77.8
SUPV3L1Q8IYB8 PTBP2-202ENST00000370198 3054 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.044e-6■■■■■ 77.8
SUPV3L1Q8IYB8 PTBP2-207ENST00000476419 1691 ntTSL 1 (best)7.81□□□□□ -1.164e-6■■■■■ 77.8
SUPV3L1Q8IYB8 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.854e-6■■■■■ 77.8
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