Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG16L1Q676U5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L1Q676U5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms