Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL38Q2WGJ6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL38Q2WGJ6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL38Q2WGJ6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL38Q2WGJ6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL38Q2WGJ6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL38Q2WGJ6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL38Q2WGJ6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL38Q2WGJ6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL38Q2WGJ6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL38Q2WGJ6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL38Q2WGJ6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms