Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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