Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRADDQ15628 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRADDQ15628 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRADDQ15628 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRADDQ15628 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRADDQ15628 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRADDQ15628 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRADDQ15628 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRADDQ15628 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRADDQ15628 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRADDQ15628 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRADDQ15628 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRADDQ15628 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRADDQ15628 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRADDQ15628 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRADDQ15628 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRADDQ15628 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRADDQ15628 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRADDQ15628 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRADDQ15628 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRADDQ15628 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRADDQ15628 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRADDQ15628 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRADDQ15628 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRADDQ15628 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRADDQ15628 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRADDQ15628 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRADDQ15628 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRADDQ15628 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRADDQ15628 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRADDQ15628 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRADDQ15628 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRADDQ15628 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRADDQ15628 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRADDQ15628 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRADDQ15628 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRADDQ15628 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRADDQ15628 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRADDQ15628 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRADDQ15628 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRADDQ15628 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRADDQ15628 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRADDQ15628 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRADDQ15628 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRADDQ15628 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRADDQ15628 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRADDQ15628 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRADDQ15628 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRADDQ15628 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRADDQ15628 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRADDQ15628 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRADDQ15628 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRADDQ15628 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRADDQ15628 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRADDQ15628 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRADDQ15628 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRADDQ15628 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRADDQ15628 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRADDQ15628 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRADDQ15628 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRADDQ15628 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRADDQ15628 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRADDQ15628 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRADDQ15628 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRADDQ15628 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRADDQ15628 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRADDQ15628 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRADDQ15628 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRADDQ15628 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRADDQ15628 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRADDQ15628 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRADDQ15628 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRADDQ15628 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRADDQ15628 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRADDQ15628 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRADDQ15628 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRADDQ15628 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRADDQ15628 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TRADDQ15628 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRADDQ15628 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TRADDQ15628 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRADDQ15628 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRADDQ15628 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRADDQ15628 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRADDQ15628 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRADDQ15628 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRADDQ15628 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRADDQ15628 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRADDQ15628 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRADDQ15628 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TRADDQ15628 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRADDQ15628 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRADDQ15628 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRADDQ15628 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRADDQ15628 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRADDQ15628 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRADDQ15628 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRADDQ15628 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRADDQ15628 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRADDQ15628 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
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