Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPN13Q12923 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN13Q12923 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
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