Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMTP48728 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMTP48728 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMTP48728 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMTP48728 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMTP48728 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMTP48728 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMTP48728 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMTP48728 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMTP48728 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMTP48728 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMTP48728 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMTP48728 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMTP48728 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMTP48728 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMTP48728 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMTP48728 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMTP48728 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMTP48728 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMTP48728 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMTP48728 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMTP48728 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AMTP48728 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMTP48728 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMTP48728 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMTP48728 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMTP48728 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMTP48728 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AMTP48728 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMTP48728 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AMTP48728 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMTP48728 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMTP48728 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMTP48728 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMTP48728 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMTP48728 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMTP48728 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMTP48728 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMTP48728 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMTP48728 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMTP48728 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMTP48728 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AMTP48728 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms