Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA8P48165 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA8P48165 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA8P48165 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA8P48165 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA8P48165 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA8P48165 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA8P48165 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA8P48165 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA8P48165 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA8P48165 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA8P48165 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA8P48165 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA8P48165 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA8P48165 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA8P48165 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA8P48165 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA8P48165 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA8P48165 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA8P48165 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA8P48165 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA8P48165 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA8P48165 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJA8P48165 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJA8P48165 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA8P48165 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA8P48165 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA8P48165 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA8P48165 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA8P48165 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA8P48165 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA8P48165 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA8P48165 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA8P48165 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA8P48165 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJA8P48165 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJA8P48165 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJA8P48165 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJA8P48165 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJA8P48165 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJA8P48165 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJA8P48165 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJA8P48165 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJA8P48165 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJA8P48165 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJA8P48165 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJA8P48165 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA8P48165 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA8P48165 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA8P48165 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA8P48165 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA8P48165 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA8P48165 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA8P48165 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA8P48165 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA8P48165 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA8P48165 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA8P48165 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA8P48165 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA8P48165 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJA8P48165 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA8P48165 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA8P48165 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA8P48165 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA8P48165 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA8P48165 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA8P48165 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA8P48165 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA8P48165 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA8P48165 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA8P48165 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA8P48165 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA8P48165 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA8P48165 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA8P48165 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA8P48165 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJA8P48165 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA8P48165 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA8P48165 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA8P48165 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA8P48165 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA8P48165 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA8P48165 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA8P48165 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA8P48165 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA8P48165 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA8P48165 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA8P48165 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJA8P48165 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA8P48165 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA8P48165 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA8P48165 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA8P48165 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA8P48165 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA8P48165 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA8P48165 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA8P48165 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA8P48165 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA8P48165 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA8P48165 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms