Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM225BP0DP42 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms