Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms