Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
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