Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
GRIN2BQ13224 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GRIN2BQ13224 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
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