Protein–RNA interactions for Protein: Q13166

CATR1, CATR tumorigenic conversion 1 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATR1Q13166 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CATR1Q13166 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms