Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSDMDP57764 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms