Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB5AP20339 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms