Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms