Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK1P06493 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK1P06493 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK1P06493 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK1P06493 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK1P06493 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK1P06493 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK1P06493 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK1P06493 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK1P06493 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK1P06493 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK1P06493 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK1P06493 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK1P06493 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK1P06493 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK1P06493 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK1P06493 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK1P06493 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK1P06493 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK1P06493 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK1P06493 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK1P06493 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK1P06493 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK1P06493 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK1P06493 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK1P06493 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK1P06493 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK1P06493 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK1P06493 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK1P06493 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK1P06493 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK1P06493 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK1P06493 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK1P06493 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK1P06493 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK1P06493 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK1P06493 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK1P06493 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK1P06493 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK1P06493 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK1P06493 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK1P06493 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK1P06493 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK1P06493 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK1P06493 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK1P06493 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK1P06493 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK1P06493 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK1P06493 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK1P06493 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK1P06493 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK1P06493 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK1P06493 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK1P06493 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK1P06493 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK1P06493 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK1P06493 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK1P06493 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK1P06493 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK1P06493 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK1P06493 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK1P06493 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK1P06493 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK1P06493 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK1P06493 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK1P06493 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK1P06493 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK1P06493 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK1P06493 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK1P06493 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK1P06493 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK1P06493 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK1P06493 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK1P06493 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK1P06493 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK1P06493 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK1P06493 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK1P06493 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK1P06493 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK1P06493 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK1P06493 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK1P06493 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK1P06493 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK1P06493 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK1P06493 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK1P06493 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK1P06493 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK1P06493 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK1P06493 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK1P06493 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK1P06493 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK1P06493 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK1P06493 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK1P06493 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK1P06493 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK1P06493 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK1P06493 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK1P06493 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK1P06493 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK1P06493 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms