Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARD11Q9BXL7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARD11Q9BXL7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms