Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GATAD2BQ8WXI9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GATAD2BQ8WXI9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GATAD2BQ8WXI9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GATAD2BQ8WXI9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GATAD2BQ8WXI9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GATAD2BQ8WXI9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GATAD2BQ8WXI9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GATAD2BQ8WXI9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GATAD2BQ8WXI9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GATAD2BQ8WXI9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATAD2BQ8WXI9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATAD2BQ8WXI9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATAD2BQ8WXI9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATAD2BQ8WXI9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATAD2BQ8WXI9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATAD2BQ8WXI9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATAD2BQ8WXI9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATAD2BQ8WXI9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATAD2BQ8WXI9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATAD2BQ8WXI9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATAD2BQ8WXI9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATAD2BQ8WXI9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATAD2BQ8WXI9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GATAD2BQ8WXI9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GATAD2BQ8WXI9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GATAD2BQ8WXI9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GATAD2BQ8WXI9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms