Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf139Q6ZV77 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf139Q6ZV77 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf139Q6ZV77 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf139Q6ZV77 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms