Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP4Q6PIL6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms