Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC4A8Q2Y0W8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A8Q2Y0W8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms