Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USF2Q15853 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USF2Q15853 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USF2Q15853 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USF2Q15853 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USF2Q15853 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USF2Q15853 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USF2Q15853 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USF2Q15853 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USF2Q15853 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USF2Q15853 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USF2Q15853 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USF2Q15853 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USF2Q15853 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USF2Q15853 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USF2Q15853 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USF2Q15853 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USF2Q15853 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USF2Q15853 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USF2Q15853 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USF2Q15853 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USF2Q15853 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
USF2Q15853 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
USF2Q15853 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
USF2Q15853 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
USF2Q15853 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USF2Q15853 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USF2Q15853 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USF2Q15853 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USF2Q15853 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USF2Q15853 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USF2Q15853 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USF2Q15853 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USF2Q15853 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USF2Q15853 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USF2Q15853 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USF2Q15853 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USF2Q15853 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USF2Q15853 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USF2Q15853 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USF2Q15853 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USF2Q15853 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USF2Q15853 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USF2Q15853 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USF2Q15853 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USF2Q15853 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USF2Q15853 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USF2Q15853 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USF2Q15853 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USF2Q15853 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USF2Q15853 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USF2Q15853 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USF2Q15853 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USF2Q15853 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USF2Q15853 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USF2Q15853 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USF2Q15853 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USF2Q15853 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USF2Q15853 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USF2Q15853 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USF2Q15853 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USF2Q15853 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USF2Q15853 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USF2Q15853 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USF2Q15853 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USF2Q15853 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USF2Q15853 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USF2Q15853 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USF2Q15853 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USF2Q15853 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USF2Q15853 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USF2Q15853 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USF2Q15853 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USF2Q15853 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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