Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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TP53BP1Q12888 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TP53BP1Q12888 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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TP53BP1Q12888 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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TP53BP1Q12888 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
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TP53BP1Q12888 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TP53BP1Q12888 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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TP53BP1Q12888 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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TP53BP1Q12888 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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TP53BP1Q12888 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TP53BP1Q12888 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TP53BP1Q12888 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TP53BP1Q12888 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TP53BP1Q12888 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TP53BP1Q12888 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TP53BP1Q12888 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TP53BP1Q12888 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TP53BP1Q12888 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TP53BP1Q12888 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TP53BP1Q12888 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TP53BP1Q12888 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TP53BP1Q12888 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TP53BP1Q12888 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TP53BP1Q12888 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TP53BP1Q12888 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TP53BP1Q12888 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TP53BP1Q12888 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TP53BP1Q12888 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TP53BP1Q12888 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TP53BP1Q12888 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TP53BP1Q12888 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TP53BP1Q12888 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TP53BP1Q12888 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TP53BP1Q12888 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
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