Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTA1P68133 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms