Protein–RNA interactions for Protein: P68032

ACTC1, Actin, alpha cardiac muscle 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTC1P68032 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTC1P68032 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms