Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCE1P61221 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms