Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDIT3P35638 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDIT3P35638 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms