Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms