Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SS18L2Q9UHA2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms