Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC43.05■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC43.05■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC43.04■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC43.02■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
CCDC180Q9P1Z9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC43.01■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC43■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC43■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC43■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms