Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PBRM1Q86U86 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PBRM1Q86U86 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms