Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms