Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.397e-10■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 SGSM3-207ENST00000469719 1029 ntTSL 517.39■□□□□ 0.376e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.376e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 ARHGEF1-213ENST00000595897 2973 ntTSL 1 (best)17.37■□□□□ 0.372e-19■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 RIC8A-210ENST00000528357 500 ntTSL 417.35■□□□□ 0.376e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.346e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 DBN1-206ENST00000472831 2667 ntTSL 217.02■□□□□ 0.316e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.36e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 CLASRP-206ENST00000585615 633 ntTSL 216.91■□□□□ 0.36e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.287e-10■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 AP2A1-205ENST00000597774 2196 ntTSL 516.82■□□□□ 0.286e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 VARS-223ENST00000474643 885 ntTSL 516.78■□□□□ 0.286e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 SGSM3-205ENST00000462457 881 ntTSL 516.7■□□□□ 0.266e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.256e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 AP2A1-207ENST00000600466 2903 ntTSL 216.59■□□□□ 0.256e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 PSMC4-203ENST00000593455 1532 ntTSL 516.4■□□□□ 0.227e-10■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.216e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 SGSM3-202ENST00000417424 666 ntTSL 516.31■□□□□ 0.26e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 RIC8A-205ENST00000526982 965 ntTSL 316.13■□□□□ 0.176e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 NECAB3-219ENST00000606690 900 ntTSL 516.02■□□□□ 0.164e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 NECAB3-203ENST00000439478 925 ntTSL 516.02■□□□□ 0.164e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.146e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.148e-13■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 SPTBN2-203ENST00000528051 573 ntTSL 215.68■□□□□ 0.18e-6■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 VARS-225ENST00000482996 728 ntTSL 315.43■□□□□ 0.066e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 DBN1-208ENST00000505550 534 ntTSL 215.41■□□□□ 0.066e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 VARS-226ENST00000483275 450 ntTSL 315.4■□□□□ 0.066e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.036e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 RIC8A-213ENST00000530889 563 ntTSL 215.01□□□□□ -0.016e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.037e-10■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 AP2A1-203ENST00000593788 611 ntTSL 314.61□□□□□ -0.076e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 PSMC4-206ENST00000601697 1623 ntTSL 214.61□□□□□ -0.077e-10■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 CDK4-203ENST00000546489 776 ntTSL 514.51□□□□□ -0.097e-10■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 DBN1-211ENST00000514833 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 414.46□□□□□ -0.096e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.096e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.16e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.126e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 PIAS3-208ENST00000484423 1042 ntTSL 214.25□□□□□ -0.136e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 PIAS3-205ENST00000463514 429 ntTSL 314.22□□□□□ -0.136e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.167e-10■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 IL4I1-207ENST00000597295 651 ntTSL 313.91□□□□□ -0.188e-13■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.196e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.216e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.216e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 AL022238.4-201ENST00000639722 4563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.236e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.246e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 PIAS3-204ENST00000393046 952 ntTSL 213.42□□□□□ -0.266e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 MKNK2-209ENST00000589509 352 ntTSL 513.34□□□□□ -0.278e-13■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 PIAS3-209ENST00000498436 1142 ntTSL 513.28□□□□□ -0.286e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 PAFAH1B3-203ENST00000594989 649 ntTSL 513.23□□□□□ -0.297e-10■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 PIAS3-203ENST00000393045 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.36e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 IL4I1-205ENST00000596011 714 ntTSL 213.11□□□□□ -0.318e-13■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 EZR-204ENST00000476189 956 ntTSL 313□□□□□ -0.336e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.338e-6■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.388e-6■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.388e-6■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 SGSM3-213ENST00000485962 2973 ntTSL 512.44□□□□□ -0.426e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 NUP62-201ENST00000352066 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.428e-13■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 SGSM3-209ENST00000478085 4218 ntTSL 212.32□□□□□ -0.446e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.446e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 GABBR1-212ENST00000478931 837 ntTSL 312.15□□□□□ -0.466e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 FAM129A-203ENST00000461167 904 ntTSL 311.95□□□□□ -0.56e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 AGRN-203ENST00000461111 3385 ntTSL 1 (best)11.91□□□□□ -0.57e-10■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.58e-13■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 AARS-201ENST00000261772 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.518e-6■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 DHRS11-209ENST00000610443 4505 nt11.81□□□□□ -0.526e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 SPTBN2-211ENST00000617502 3498 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.538e-6■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 PIAS3-202ENST00000369299 1235 ntTSL 211.05□□□□□ -0.646e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 ATG13-218ENST00000531933 583 ntTSL 311.04□□□□□ -0.646e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 FAM3A-221ENST00000612856 3995 ntTSL 210.93□□□□□ -0.666e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 DHRS11-214ENST00000617959 976 ntTSL 210.87□□□□□ -0.676e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 FAM129A-204ENST00000487074 3118 ntTSL 510.01□□□□□ -0.816e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 ATG13-207ENST00000526508 4199 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.846e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 NUP62-202ENST00000422090 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.858e-13■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 FAM129A-201ENST00000367511 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.896e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 CDK4-213ENST00000552713 685 ntTSL 29.4□□□□□ -0.97e-10■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 ATG13-201ENST00000359513 4348 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.986e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 ATG13-203ENST00000524625 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.086e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 DHRS11-216ENST00000621871 883 ntTSL 37.23□□□□□ -1.256e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 EPRS-203ENST00000468487 458 ntTSL 26.24□□□□□ -1.416e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.154e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.034e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 MKNK2-208ENST00000589441 803 ntTSL 513.98□□□□□ -0.174e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 MKNK2-206ENST00000587416 4093 ntTSL 212.81□□□□□ -0.364e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 MKNK2-213ENST00000591601 3582 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.544e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 MKNK2-211ENST00000591142 875 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.894e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 ARHGAP19-SLIT1-202ENST00000479633 1876 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.572e-8■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 ARHGAP19-203ENST00000371027 2301 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.742e-8■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 ARHGAP19-201ENST00000358308 5390 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.82e-8■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 ARHGAP19-202ENST00000358531 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.952e-8■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 ARHGAP19-206ENST00000492211 5525 ntTSL 28.16□□□□□ -1.12e-8■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 ARHGAP19-205ENST00000487035 4553 ntTSL 27.23□□□□□ -1.252e-8■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 EIF4G1-224ENST00000444861 2384 ntTSL 1 (best)21.52■■□□□ 1.041e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.513e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.483e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 R3HDM4-204ENST00000589428 1704 ntTSL 323.39■■□□□ 1.343e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.83e-6■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.783e-6■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.193e-6■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.163e-6■■■■□ 21.8
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