Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 FCHO1-214ENST00000596507 1014 ntTSL 513.27□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FCHO1-222ENST00000597718 884 ntTSL 513.27□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DNAJB12-206ENST00000473051 717 ntTSL 1 (best)13.26□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ADAP1-202ENST00000435943 559 ntTSL 513.25□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KDM6B-206ENST00000575521 219 ntTSL 513.21□□□□□ -0.292e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CSF3R-204ENST00000373104 2953 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LIMK1-201ENST00000336180 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 B3GNTL1-206ENST00000571954 881 ntTSL 513.18□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 HEXIM2-202ENST00000585340 803 ntTSL 313.17□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZNF664-205ENST00000539257 271 ntTSL 513.16□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FCHO1-234ENST00000600676 3094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AC016876.1-203ENST00000417897 299 ntTSL 213.14□□□□□ -0.313e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ARMC6-216ENST00000541725 560 ntTSL 513.1□□□□□ -0.313e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 METTL13-201ENST00000361735 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.313e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DNAJC8-204ENST00000488868 786 ntTSL 413.08□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDX19B-214ENST00000569099 494 ntTSL 513.08□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ADGRG1-263ENST00000568645 896 ntTSL 313.07□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NEDD1-205ENST00000553609 581 ntTSL 313.06□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CEP164-213ENST00000533706 5035 ntTSL 513.01□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CHEK1-203ENST00000428830 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FCHO1-208ENST00000595033 2907 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FCHO1-228ENST00000599236 586 ntTSL 512.96□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SOCS6-201ENST00000397942 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.342e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.343e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.343e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NSMCE1-208ENST00000565070 1853 ntTSL 512.93□□□□□ -0.343e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ACAD8-210ENST00000527665 1475 ntTSL 412.9□□□□□ -0.343e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZMYND11-203ENST00000381591 4229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RFX5-203ENST00000392746 2056 ntTSL 512.88□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 POLR3H-203ENST00000396504 4176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SEMA3F-208ENST00000470737 566 ntTSL 512.86□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZNF664-203ENST00000537532 592 ntTSL 412.85□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SSH2-203ENST00000394848 1796 ntTSL 1 (best)12.84□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RFX5-207ENST00000430227 585 ntTSL 412.84□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RFX5-216ENST00000458484 537 ntTSL 312.84□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ITPK1-212ENST00000557309 770 ntTSL 312.8□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CNTROB-210ENST00000575408 917 ntTSL 312.79□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CSF3R-206ENST00000464365 1659 ntTSL 512.79□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FCHO1-217ENST00000596865 579 ntTSL 512.77□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 INPP5A-205ENST00000445580 610 ntTSL 512.74□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZNF664-213ENST00000543017 455 ntTSL 512.74□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NEDD1-206ENST00000554226 582 ntTSL 212.74□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FBXO3-211ENST00000532927 945 ntTSL 212.72□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DCLRE1C-210ENST00000378289 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PYCR3-205ENST00000462036 579 ntTSL 412.69□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 C1RL-AS1-201ENST00000382215 2086 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NUMA1-219ENST00000541262 706 ntTSL 312.64□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FCHO1-204ENST00000593870 567 ntTSL 412.62□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FCHO1-224ENST00000598086 554 ntTSL 412.62□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LIMK1-202ENST00000418310 3360 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DCP1B-204ENST00000537725 598 ntTSL 312.6□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TCOF1-209ENST00000506630 897 ntTSL 512.6□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ADGRG1-233ENST00000564912 841 ntTSL 512.6□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DPAGT1-207ENST00000460183 1058 ntTSL 212.6□□□□□ -0.392e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CAPNS1-213ENST00000592354 690 ntTSL 212.57□□□□□ -0.44e-8■■■■■ 41.9
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EFTUD2Q15029 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ANGEL1-201ENST00000251089 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 41.9
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EFTUD2Q15029 SSR4-211ENST00000486204 658 ntTSL 312.5□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CNDP2-202ENST00000324301 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 BCR-204ENST00000427791 771 ntTSL 1 (best)12.49□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SETMAR-201ENST00000358065 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CSF3R-210ENST00000480825 6074 ntTSL 212.48□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MYO10-210ENST00000513610 8038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 HSPA4-201ENST00000304858 4825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.425e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FCHO1-202ENST00000593385 573 ntTSL 512.44□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FCHO1-225ENST00000598539 551 ntTSL 512.44□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CNTROB-206ENST00000571540 1209 ntTSL 512.43□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PC-212ENST00000531614 690 ntTSL 512.43□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CSF3R-202ENST00000361632 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NSMCE1-214ENST00000569236 1782 ntTSL 212.41□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CEP164-209ENST00000533223 5690 ntTSL 1 (best)12.4□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RFX5-221ENST00000494217 588 ntTSL 1 (best)12.39□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ADGRG1-204ENST00000561696 594 ntTSL 512.37□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ADGRG1-266ENST00000568908 3852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GNB5-201ENST00000261837 8906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PHLDB1-217ENST00000530708 874 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AP4M1-213ENST00000463195 1020 ntTSL 212.34□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KLC2-202ENST00000394065 3755 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RIN1-208ENST00000627248 243 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SMUG1-210ENST00000505597 494 ntTSL 512.32□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SSH3-207ENST00000531495 548 ntTSL 212.3□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SF3B2-212ENST00000531589 616 ntTSL 212.29□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ELOVL1-213ENST00000496932 779 ntTSL 312.29□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CEP164-212ENST00000533675 4761 ntTSL 212.28□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TYRO3-203ENST00000559815 535 ntTSL 512.28□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 UBAP2-211ENST00000488443 492 ntTSL 512.28□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TEAD2-209ENST00000598823 566 ntTSL 512.27□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NIF3L1-201ENST00000359683 1626 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.452e-11■■■■■ 41.9
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