RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532927.5

FBXO3-211, Transcript of F-box protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene FBXO3, Length 945 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3-211ENST00000532927 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.36■■■□□ 2.93
FBXO3-211ENST00000532927 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.88■■■□□ 2.37
FBXO3-211ENST00000532927 ABCC9O60706 1549 aa29.81■■■□□ 2.36
FBXO3-211ENST00000532927 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.39■■■□□ 2.14
FBXO3-211ENST00000532927 NACADO15069 1562 aa28.23■■■□□ 2.11
FBXO3-211ENST00000532927 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.08■■■□□ 2.09
FBXO3-211ENST00000532927 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.98■■■□□ 2.07
FBXO3-211ENST00000532927 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.88■■■□□ 2.05
FBXO3-211ENST00000532927 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.81■■■□□ 2.04
FBXO3-211ENST00000532927 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.78■■■□□ 2.04
FBXO3-211ENST00000532927 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
FBXO3-211ENST00000532927 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.63■■■□□ 2.01
FBXO3-211ENST00000532927 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.56■■■□□ 2
FBXO3-211ENST00000532927 SCRIBQ14160 1630 aa27.23■■□□□ 1.95
FBXO3-211ENST00000532927 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.19■■□□□ 1.94
FBXO3-211ENST00000532927 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.94■■□□□ 1.9
FBXO3-211ENST00000532927 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
FBXO3-211ENST00000532927 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.84■■□□□ 1.89
FBXO3-211ENST00000532927 NCAPD3P42695 1498 aa26.08■■□□□ 1.77
FBXO3-211ENST00000532927 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.01■■□□□ 1.75
FBXO3-211ENST00000532927 SMARCA4P51532 1647 aa26■■□□□ 1.75
FBXO3-211ENST00000532927 SMARCA2P51531 1590 aa25.91■■□□□ 1.74
FBXO3-211ENST00000532927 HMGXB3Q12766 1538 aa25.88■■□□□ 1.73
FBXO3-211ENST00000532927 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
FBXO3-211ENST00000532927 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.76■■□□□ 1.71
FBXO3-211ENST00000532927 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
FBXO3-211ENST00000532927 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.72■■□□□ 1.71
FBXO3-211ENST00000532927 ERCC6Q03468 1493 aa25.69■■□□□ 1.7
FBXO3-211ENST00000532927 NESP48681 1621 aa25.66■■□□□ 1.7
FBXO3-211ENST00000532927 CUX2O14529 1486 aa25.65■■□□□ 1.7
FBXO3-211ENST00000532927 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.59■■□□□ 1.69
FBXO3-211ENST00000532927 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.45■■□□□ 1.66
FBXO3-211ENST00000532927 WIZO95785 1651 aa25.41■■□□□ 1.66
FBXO3-211ENST00000532927 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
FBXO3-211ENST00000532927 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.32■■□□□ 1.64
FBXO3-211ENST00000532927 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.29■■□□□ 1.64
FBXO3-211ENST00000532927 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.29■■□□□ 1.64
FBXO3-211ENST00000532927 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
FBXO3-211ENST00000532927 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.08■■□□□ 1.6
FBXO3-211ENST00000532927 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
FBXO3-211ENST00000532927 WDR62O43379 1518 aa25.02■■□□□ 1.6
FBXO3-211ENST00000532927 CFTRP13569 1480 aa25.02■■□□□ 1.6
FBXO3-211ENST00000532927 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.98■■□□□ 1.59
FBXO3-211ENST00000532927 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.98■■□□□ 1.59
FBXO3-211ENST00000532927 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.82■■□□□ 1.56
FBXO3-211ENST00000532927 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
FBXO3-211ENST00000532927 PRDM2Q13029 1718 aa24.76■■□□□ 1.55
FBXO3-211ENST00000532927 TOPBP1Q92547 1522 aa24.54■■□□□ 1.52
FBXO3-211ENST00000532927 IFT140Q96RY7 1462 aa24.5■■□□□ 1.51
FBXO3-211ENST00000532927 OSCARQ8IYS5 282 aa24.49■■□□□ 1.51
FBXO3-211ENST00000532927 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
FBXO3-211ENST00000532927 ABCC8Q09428 1581 aa24.45■■□□□ 1.5
FBXO3-211ENST00000532927 TRIM41Q8WV44 630 aa24.44■■□□□ 1.5
FBXO3-211ENST00000532927 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.44■■□□□ 1.5
FBXO3-211ENST00000532927 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
FBXO3-211ENST00000532927 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
FBXO3-211ENST00000532927 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
FBXO3-211ENST00000532927 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.486e-9■■■■■ 37.6
FBXO3-211ENST00000532927 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.21■■□□□ 1.47
FBXO3-211ENST00000532927 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.18■■□□□ 1.46
FBXO3-211ENST00000532927 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.18■■□□□ 1.46
FBXO3-211ENST00000532927 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.18■■□□□ 1.46
FBXO3-211ENST00000532927 SOGA1O94964 1423 aa24.18■■□□□ 1.46
FBXO3-211ENST00000532927 CUX1P39880 1505 aa24.15■■□□□ 1.46
FBXO3-211ENST00000532927 CHD1O14646 1710 aa24.14■■□□□ 1.45
FBXO3-211ENST00000532927 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.13■■□□□ 1.45
FBXO3-211ENST00000532927 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
FBXO3-211ENST00000532927 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
FBXO3-211ENST00000532927 ARHGEF11O15085 1522 aa24.11■■□□□ 1.45
FBXO3-211ENST00000532927 FBLN2P98095 1184 aa24.05■■□□□ 1.44
FBXO3-211ENST00000532927 WDR97A6NE52 1622 aa24.03■■□□□ 1.44
FBXO3-211ENST00000532927 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24■■□□□ 1.43
FBXO3-211ENST00000532927 GRIN2BQ13224 1484 aa23.94■■□□□ 1.42
FBXO3-211ENST00000532927 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
FBXO3-211ENST00000532927 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.92■■□□□ 1.42
FBXO3-211ENST00000532927 ARAP1Q96P48 1450 aa23.89■■□□□ 1.42
FBXO3-211ENST00000532927 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
FBXO3-211ENST00000532927 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.88■■□□□ 1.41
FBXO3-211ENST00000532927 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.88■■□□□ 1.41
FBXO3-211ENST00000532927 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.87■■□□□ 1.41
FBXO3-211ENST00000532927 SYNJ2O15056 1496 aa23.86■■□□□ 1.41
FBXO3-211ENST00000532927 PBRM1Q86U86 1689 aa23.86■■□□□ 1.41
FBXO3-211ENST00000532927 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.84■■□□□ 1.41
FBXO3-211ENST00000532927 SYNJ1O43426 1573 aa23.82■■□□□ 1.4
FBXO3-211ENST00000532927 TOP2BQ02880 1626 aa23.77■■□□□ 1.4
FBXO3-211ENST00000532927 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.77■■□□□ 1.4
FBXO3-211ENST00000532927 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.77■■□□□ 1.4
FBXO3-211ENST00000532927 GRIN2AQ12879 1464 aa23.64■■□□□ 1.38
FBXO3-211ENST00000532927 ADAMTS12P58397 1594 aa23.64■■□□□ 1.37
FBXO3-211ENST00000532927 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
FBXO3-211ENST00000532927 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.58■■□□□ 1.36
FBXO3-211ENST00000532927 NUP160Q12769 1436 aa23.58■■□□□ 1.36
FBXO3-211ENST00000532927 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.57■■□□□ 1.36
FBXO3-211ENST00000532927 CEP170Q5SW79 1584 aa23.57■■□□□ 1.36
FBXO3-211ENST00000532927 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.53■■□□□ 1.36
FBXO3-211ENST00000532927 SHROOM2Q13796 1616 aa23.47■■□□□ 1.35
FBXO3-211ENST00000532927 JPH4Q96JJ6 628 aa23.34■■□□□ 1.33
FBXO3-211ENST00000532927 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
FBXO3-211ENST00000532927 IGF1RP08069 1367 aa23.32■■□□□ 1.32
FBXO3-211ENST00000532927 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.3■■□□□ 1.32
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