Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GINS1Q14691 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GINS1Q14691 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GINS1Q14691 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GINS1Q14691 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GINS1Q14691 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GINS1Q14691 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GINS1Q14691 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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