Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.142e-11■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.222e-11■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.632e-11■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 ARF1-209ENST00000478424 1059 ntTSL 226.6■■□□□ 1.852e-14■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.932e-14■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 STXBP2-205ENST00000593854 704 ntTSL 219.38■□□□□ 0.694e-6■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.242e-14■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 STXBP2-214ENST00000599400 811 ntTSL 516.02■□□□□ 0.164e-6■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 STXBP2-219ENST00000600702 770 ntTSL 214.39□□□□□ -0.114e-6■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.237e-9■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 GDI2-204ENST00000418688 636 ntTSL 512.8□□□□□ -0.367e-9■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 GDI2-206ENST00000456041 918 ntTSL 511.87□□□□□ -0.517e-9■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 GDI2-209ENST00000609712 622 ntTSL 311.12□□□□□ -0.637e-9■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 GDI2-202ENST00000380181 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.647e-9■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 ARF1-201ENST00000272102 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.732e-14■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 GDI2-208ENST00000608581 634 ntTSL 39.76□□□□□ -0.857e-9■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 GDI2-201ENST00000380127 584 ntTSL 38.5□□□□□ -1.057e-9■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 APLP2-207ENST00000525604 1590 ntTSL 215.52■□□□□ 0.072e-6■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 APLP2-222ENST00000533860 1424 ntTSL 1 (best)14.49□□□□□ -0.092e-6■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 APLP2-215ENST00000530493 1322 ntTSL 211.6□□□□□ -0.552e-6■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 BCOR-210ENST00000442018 2189 ntTSL 210.51□□□□□ -0.732e-6■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 BCOR-209ENST00000427012 1969 ntTSL 58.29□□□□□ -1.082e-6■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.761e-6■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.051e-6■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 GSPT1-201ENST00000420576 1603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.651e-6■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 DIAPH1-205ENST00000448451 2102 ntTSL 213.42□□□□□ -0.263e-6■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.163e-9■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.093e-9■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 TALDO1-205ENST00000530440 710 ntTSL 312.9□□□□□ -0.343e-9■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 CLINT1-209ENST00000530302 668 ntTSL 27.4□□□□□ -1.226e-10■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 CLINT1-204ENST00000521615 399 ntTSL 35.1□□□□□ -1.596e-10■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.014e-6■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 SGMS1-209ENST00000609445 594 ntTSL 417.09■□□□□ 0.334e-6■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.334e-6■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.354e-6■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.834e-7■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.134e-7■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 GMNN-203ENST00000378054 653 ntTSL 317.45■□□□□ 0.389e-7■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.329e-7■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 GMNN-202ENST00000356509 1133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.49e-7■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 GMNN-207ENST00000620958 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.429e-7■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 09e-10■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71e-9■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.724e-11■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 AP2M1-212ENST00000461733 1470 ntTSL 215.39■□□□□ 0.054e-11■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.054e-11■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.194e-11■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 MRPL21-203ENST00000536637 557 ntTSL 212.69□□□□□ -0.384e-11■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 KMT5A-203ENST00000437502 901 ntTSL 511.65□□□□□ -0.544e-11■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 KMT5A-208ENST00000485469 454 ntTSL 33.93□□□□□ -1.784e-11■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.221e-8■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 DDX21-201ENST00000354185 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.21e-8■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 SFPQ-202ENST00000460428 464 ntTSL 27.57□□□□□ -1.21e-18■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 SUPT5H-205ENST00000593727 493 ntTSL 36.8□□□□□ -1.321e-6■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 RALBP1-205ENST00000585015 945 ntTSL 325.23■■□□□ 1.632e-11■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 MPHOSPH8-201ENST00000361479 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.834e-6■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 MTA1-214ENST00000494026 852 ntTSL 519.01■□□□□ 0.634e-6■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 MTA1-216ENST00000498644 871 ntTSL 217.72■□□□□ 0.434e-6■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 MTA1-204ENST00000424723 904 ntTSL 1 (best)16.47■□□□□ 0.234e-6■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 MYO18A-218ENST00000546105 1442 ntTSL 219.77■□□□□ 0.769e-10■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 MYO18A-206ENST00000529889 698 ntTSL 214.61□□□□□ -0.079e-10■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 MYO18A-205ENST00000529578 2667 ntTSL 212.07□□□□□ -0.489e-10■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 MYO18A-212ENST00000531892 599 ntTSL 311.95□□□□□ -0.59e-10■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 MYO18A-211ENST00000531438 565 ntTSL 410.89□□□□□ -0.679e-10■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.189e-17■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.094e-7■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 NOLC1-206ENST00000477977 660 ntTSL 36.9□□□□□ -1.34e-7■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 ACTN4-211ENST00000589528 441 ntTSL 216.95■□□□□ 0.36e-7■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.186e-7■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 PTBP1-219ENST00000621737 1125 ntTSL 520.57■□□□□ 0.882e-10■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.061e-6■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.051e-6■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.071e-6■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 CLASRP-207ENST00000587112 867 ntTSL 1 (best)12.99□□□□□ -0.334e-15■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 CLASRP-213ENST00000591410 572 ntTSL 411.88□□□□□ -0.514e-15■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 CLASRP-209ENST00000588016 967 ntTSL 28.9□□□□□ -0.984e-15■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 KRI1-211ENST00000543842 635 ntTSL 517.58■□□□□ 0.41e-6■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 SDF4-203ENST00000403997 728 ntTSL 313.93□□□□□ -0.181e-6■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 CCT3-212ENST00000478640 583 ntTSL 211.98□□□□□ -0.491e-8■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 CCT3-215ENST00000496684 748 ntTSL 28.65□□□□□ -1.021e-8■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 CCT3-208ENST00000415548 513 ntTSL 38.61□□□□□ -1.031e-8■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 CCT3-216ENST00000533194 581 ntTSL 38.04□□□□□ -1.121e-8■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 CCT3-207ENST00000413555 842 ntTSL 56.33□□□□□ -1.41e-8■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 CCT3-210ENST00000463132 610 ntTSL 35.64□□□□□ -1.511e-8■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 CCT3-209ENST00000446905 593 ntTSL 34.91□□□□□ -1.621e-8■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 CCT3-214ENST00000490221 696 ntTSL 24.9□□□□□ -1.631e-8■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.653e-11■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.341e-9■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.41e-9■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 DVL1-207ENST00000633096 580 ntTSL 424.82■■□□□ 1.565e-7■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 DVL1-208ENST00000634054 828 ntTSL 523.15■■□□□ 1.35e-7■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.23e-7■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.293e-7■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 NRDC-206ENST00000473805 1013 ntTSL 36.53□□□□□ -1.361e-8■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 NAP1L1-207ENST00000547479 623 ntTSL 510.35□□□□□ -0.751e-323■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 TPM3-218ENST00000505010 540 ntTSL 29.69□□□□□ -0.867e-23■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.073e-9■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 PFDN5-207ENST00000549759 559 ntTSL 312.71□□□□□ -0.373e-9■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 PFDN5-204ENST00000547130 559 ntTSL 212.52□□□□□ -0.413e-9■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 PFDN5-212ENST00000550880 595 ntTSL 212.45□□□□□ -0.423e-9■■□□□ 12.2
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