Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPSQ13938 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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