Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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GTF3C1Q12789 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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GTF3C1Q12789 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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GTF3C1Q12789 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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