Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2A1P52655 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2A1P52655 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms