Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 HSPA9-209ENST00000507886 551 ntTSL 310.32□□□□□ -0.767e-6■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 PNISR-207ENST00000478777 2422 ntTSL 29.93□□□□□ -0.827e-6■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 HSF4-219ENST00000522027 447 ntTSL 39.85□□□□□ -0.837e-6■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 PNISR-204ENST00000463021 1939 ntTSL 1 (best)6.64□□□□□ -1.357e-6■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.397e-6■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.627e-6■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 ANP32E-204ENST00000532744 621 ntTSL 317.18■□□□□ 0.349e-13■□□□□ 8.5
UTP3Q9NQZ2 ANP32E-206ENST00000534220 512 ntTSL 59.77□□□□□ -0.859e-13■□□□□ 8.5
UTP3Q9NQZ2 CSNK2B-205ENST00000465481 579 ntTSL 1 (best)15.37■□□□□ 0.058e-9■□□□□ 8.5
UTP3Q9NQZ2 CSNK2B-207ENST00000475875 590 ntTSL 1 (best)15.37■□□□□ 0.058e-9■□□□□ 8.5
UTP3Q9NQZ2 GSTP1-206ENST00000495996 221 ntTSL 29.69□□□□□ -0.863e-9■□□□□ 8.5
UTP3Q9NQZ2 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.96□□□□□ -1.782e-59■□□□□ 8.5
UTP3Q9NQZ2 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.741e-9■□□□□ 8.4
UTP3Q9NQZ2 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC7.13□□□□□ -1.271e-9■□□□□ 8.4
UTP3Q9NQZ2 PTCD3-216ENST00000487043 1054 ntTSL 36.48□□□□□ -1.371e-9■□□□□ 8.4
UTP3Q9NQZ2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.223e-6■□□□□ 8.4
UTP3Q9NQZ2 PCMT1-209ENST00000494411 600 ntTSL 420.39■□□□□ 0.853e-6■□□□□ 8.4
UTP3Q9NQZ2 PCMT1-207ENST00000484601 1095 ntTSL 519.11■□□□□ 0.653e-6■□□□□ 8.4
UTP3Q9NQZ2 PCMT1-204ENST00000460828 582 ntTSL 517.89■□□□□ 0.453e-6■□□□□ 8.4
UTP3Q9NQZ2 PCMT1-208ENST00000486585 801 ntTSL 310.44□□□□□ -0.743e-6■□□□□ 8.4
UTP3Q9NQZ2 SNORD15A-201ENST00000384214 148 ntBASIC7.95□□□□□ -1.141e-8■□□□□ 8.3
UTP3Q9NQZ2 ALDOA-214ENST00000564688 613 ntTSL 512.4□□□□□ -0.423e-14■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 FAM118A-209ENST00000476478 354 ntTSL 311.9□□□□□ -0.51e-5■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 LDHA-216ENST00000538451 1345 ntTSL 210.79□□□□□ -0.684e-9■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL4-216ENST00000569438 565 ntTSL 515.16■□□□□ 0.025e-6■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL4-212ENST00000566622 817 ntTSL 214.49□□□□□ -0.095e-6■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL4-211ENST00000566491 593 ntTSL 213.59□□□□□ -0.235e-6■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL4-214ENST00000567229 2003 ntTSL 512.75□□□□□ -0.375e-6■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL4-215ENST00000568588 1864 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.55e-6■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL4-201ENST00000307961 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.555e-6■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL4-202ENST00000561554 580 ntTSL 411.5□□□□□ -0.575e-6■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL4-205ENST00000564439 582 ntTSL 311.46□□□□□ -0.575e-6■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL4-213ENST00000566624 819 ntTSL 211.27□□□□□ -0.615e-6■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL4-217ENST00000569696 569 ntTSL 511.27□□□□□ -0.615e-6■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL4-210ENST00000566039 1099 ntTSL 29.33□□□□□ -0.925e-6■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL4-203ENST00000561775 1396 ntTSL 58.31□□□□□ -1.085e-6■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 TRIM28-211ENST00000597968 504 ntTSL 214.39□□□□□ -0.111e-9■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.784e-8■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL35A-203ENST00000439255 564 ntTSL 57.39□□□□□ -1.234e-12■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL35A-204ENST00000442341 517 ntTSL 35.89□□□□□ -1.474e-12■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.361e-6■□□□□ 8.1
UTP3Q9NQZ2 RBM39-215ENST00000442447 644 ntTSL 217.28■□□□□ 0.361e-6■□□□□ 8.1
UTP3Q9NQZ2 RBM39-219ENST00000453310 1068 ntTSL 216.82■□□□□ 0.281e-6■□□□□ 8.1
UTP3Q9NQZ2 RBM39-213ENST00000433027 611 ntTSL 516.38■□□□□ 0.211e-6■□□□□ 8.1
UTP3Q9NQZ2 RBM39-209ENST00000416529 594 ntTSL 38.01□□□□□ -1.131e-6■□□□□ 8.1
UTP3Q9NQZ2 RBM39-218ENST00000449489 432 ntTSL 57.98□□□□□ -1.131e-6■□□□□ 8.1
UTP3Q9NQZ2 RBM39-234ENST00000487604 370 ntTSL 37.84□□□□□ -1.151e-6■□□□□ 8.1
UTP3Q9NQZ2 RBM39-211ENST00000426951 840 ntTSL 1 (best)7.81□□□□□ -1.161e-6■□□□□ 8.1
UTP3Q9NQZ2 RBM39-231ENST00000477334 949 ntTSL 27.81□□□□□ -1.161e-6■□□□□ 8.1
UTP3Q9NQZ2 NOP58-203ENST00000433543 714 ntTSL 38.98□□□□□ -0.972e-15■□□□□ 8
UTP3Q9NQZ2 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC4.15□□□□□ -1.752e-15■□□□□ 8
UTP3Q9NQZ2 CD63-203ENST00000546457 607 ntTSL 214.9□□□□□ -0.024e-6■□□□□ 8
UTP3Q9NQZ2 UBA2-206ENST00000591016 646 ntTSL 24.09□□□□□ -1.754e-6■□□□□ 8
Retrieved 53 of 52,753 protein–RNA pairs in 1054.4 ms