Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF9Q13886 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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