Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFITM3Q01628 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms