Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK17Q00537 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK17Q00537 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms