Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRXO43186 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRXO43186 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRXO43186 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRXO43186 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRXO43186 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRXO43186 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRXO43186 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRXO43186 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRXO43186 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRXO43186 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CRXO43186 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRXO43186 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRXO43186 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRXO43186 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRXO43186 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRXO43186 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRXO43186 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRXO43186 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRXO43186 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRXO43186 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CRXO43186 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRXO43186 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRXO43186 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRXO43186 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRXO43186 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRXO43186 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRXO43186 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRXO43186 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRXO43186 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRXO43186 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRXO43186 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRXO43186 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRXO43186 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRXO43186 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRXO43186 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRXO43186 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRXO43186 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRXO43186 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRXO43186 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRXO43186 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRXO43186 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRXO43186 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRXO43186 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRXO43186 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRXO43186 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRXO43186 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRXO43186 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRXO43186 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRXO43186 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRXO43186 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRXO43186 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRXO43186 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRXO43186 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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